På fartyget befann sig 20 personer. 13 av dem har räddats.
"Två kroppar har återfunnits, en 20-årig man och ett barn", skriver kustbevakningen i ett uttalande.
Båten som sjönk befann sig dryg 120 meter från kusten utanför staden Gabès i södra Tunisien. Lokala myndigheter i Gabès kommer att "utreda omständigheterna kring tragedin", enligt kustbevakningen.
Under året har drygt 1 800 migranter avlidit på Medelhavet i försök att nå Europa, enligt FN:s migrationsorgan IOM.
