Översvämningarna har drabbat två östliga provinser. Dessutom har två sällsynta tornados registrerats och snöfall i vissa centrala regioner.
Fler än 2 000 människor har evakuerats från orten Nelson Mandela Bay, uppger en lokal talesperson.
Lokala myndigheter vädjar om donationer av kläder, mat och filtar.
