Av de 150 posterna i parlamentet röstade 78 personer för förändringarna, medan oppositionens parlamentariker som en protest inte deltog i omröstningen.
Förändringarna innebär att public service-bolaget RTVS inte längre kommer att existera och bytas ut mot en ny organisation.
Premiärminister Robert Fico, från det nationalistiska partiet Smer, har sagt att förändringarna behövs för att medierna är partiska och "i konflikt med den slovakiska regeringen".
Planen har kritiserats av bland annat oppositionen, internationella medieorganisationer och EU. Tusentals människor har återkommande protesterat mot den. Under torsdagen protesterade även anställda vid public service tv:n och radion.
Planen utarbetades av kulturministern Martina Simkovicová från det ultranationalistiska, högerextrema partiet SNS.
