Totalt har fler än 656 000 doser mottagits, som initialt kommer att användas för att "vaccinera 250 000 barn mellan 0 och 23 månader gamla" i 16 regioner, uppger regeringen.
Trots att antalet dödsfall kopplade till malaria har minskat i landet är sjukdomen fortfarande den främsta anledningen till att människor tar kontakt med vården, enligt landets hälsodepartement.
Vaccinet R21/Matrix-M är det andra malariavaccinet som WHO har rekommenderat för barn.
Under 2022 orsakade malaria fler än 600 000 dödsfall i världen, varav 95 procent av dem i Afrika, enligt WHO.