Fler än 90 av de dödade tillhörde islamistgruppen och 17 var soldater, enligt armén.
Det senaste året har området runt Tchadsjön plågats av upprepade terrorattacker utförda av bland andra Boko Haram och IS i Västafrika. I förra månaden dödades 40 soldater i en attack mot en militärbas i landet.
Jihadistiska Boko Haram grundades i början av 2000-talet i Tchads grannland Nigeria, och har sedan dess spridit sig till flera länder i regionen.