Polischef Bernardino Rafael angav sent på onsdagen att 150 av fångarna i högsäkerhetsfängelset kunnat gripas, rapporterar lokala medier.
Fängelseupploppet försämrade ett redan dåligt säkerhetsläge i Maputoregionen, där politisk oro krävt 20 dödsoffer bara denna vecka och hundratalet den senaste tiden. Oroligheterna har brutit ut sedan landets högsta domstol slagit fast att Frelimopartiets presidentkandidat Daniel Chapo utropats till segrare i valet.