Flickan sköts i huvudet på lördagen i staden Jenin på norra Västbanken, där Israel genomfört en offensiv den senaste veckan.
Israels militär uppger att dess styrkor skjutit mot en grupp beväpnade personer som barrikaderat sig bakom en struktur, men att rapporter inkommit om att en icke inblandad civil person skadats. Händelsen granskas nu, enligt militären.
Minst elva palestinier har dödats i Jenin sedan den israeliska offensiven inleddes. Enligt palestinska hälsomyndigheter dödades ytterligare en man på lördagen i Balata, ett flyktingläger på centrala Västbanken.