Mannan tog sig över den så kallade demarkationslinjen i den demilitariserade zonen, DMZ, mellan länderna på torsdagen.
Därefter greps han av sydkoreansk militär, meddelar Seoul.
DMZ är en av de mest minerade platserna i världen. Efter att sydkoreansk militär upptäckt mannen nära demarkationslinjen mötte de upp honom och guidade honom över gränsen.
Insatsen tog runt 20 timmar och innefattade ett stort antal soldater, enligt Seoul. Området är svårnavigerat – både på grund av tät vegetation och risken för att trampa på en mina.
Mannen, som ska vara civil, uppges frivilligt ha följt med de sydkoreanska styrkorna.
I augusti i fjol tog sig en avhoppad nordkoreansk soldat över gränsen till grannen i syd. Förra året korsade även en nordkorean gränsen havsvägen.
