Massgripandet kunde ske eftersom människor rapporterade in misstänkta till myndigheterna, säger polisens talesperson Saeed Montazeralmahdi i statlig iransk tv.
Montazeralmahdi går däremot inte in på vilka brottsrubriceringar som alla tiotusentals gripna misstänks för, utöver att fler än 260 misstänks för spioneri och 172 gripits för att ha filmat illegalt.
Under kriget, som pågick mellan den 13 och 24 juni, upprättade polisen fler än 1 000 vägspärrar i landet.
Kriget dödade nästan 1 100 iranier, bland dem många högt uppsatta militära befälhavare. Iranska angrepp dödade 28 personer i Israel.
Under veckorna som följt har Iran trappat upp antalet avrättningar. Flera som hängts har anklagats för att ha spionerat för Israel. Iran utfärdar dock dödsdomar lättvindigt, ofta efter erkännanden som tvingats fram under tortyr.