Beslutet fattades sent på söndagen lokal tid, sedan organisationen The National Immigration Law Center lämnat in en stämning samma dag, rapporterar medier i USA.
Stämningen gällde specifikt tio barn från Guatemala mellan 10 och 17 år som stod i begrepp att deporteras inom ramarna för ett pilotprogram som Trumpstyret säger sig ha förhandlat med den guatemalanska regeringen.
Domare Sparkle Sooknanans beslut gäller i två veckor och omfattar även andra minderåriga som ingår i pilotprogrammet. Enligt Axios rör det sig om över 600 barn.
Domaren, som tillsattes av den demokratiske presidenten Joe Biden, skriver att barnen riskerar ”misshandel, vanvård, förföljelse och tortyr” om de skickas tillbaka till Guatemala. De ska nu tas omhand i boenden tills frågan kan avgöras mer permanent.
Vita husets biträdande stabschef Stephen Miller är av en annan åsikt. Han skriver på X att de minderåriga uppgett att deras föräldrar är i Guatemala, men att ”en demokratisk domare hindrar dem från att återförenas med sina föräldrar”.
Att genomföra massdeportationer av migranter som vistas olagligt i landet var ett av president Donald Trumps mest tongivande vallöften under fjolårets valrörelse. Presidenten har återkommande anklagat papperslösa för våldsbrott och knarksmuggling och lovat att deportera dem.