Tusentals människor hade samlats i en marsch mot stadens campus för att kräva nyval efter påstådd korruption. Enligt nyhetsbyrån Beta hade några kastat flaskor och bengaler mot polisen.
Elva poliser skadades i sammandrabbningarna. Hur många demonstranter som skadats är oklart.
Protesterna mot regimen och korruptionen i landet har pågått sedan i november förra året då 16 personer omkom i ett takras på en tågstation i just Novi Sad.
President Alexandar Vucic anklagar demonstranterna för att hota stabiliteten och säkerheten i landet. Enligt Vucic har flera demonstranter gripits och ännu fler omhändertagits av polis.
— Serbiens folk bör veta att staten är starkare än någon annan. Det kommer alltid att vara så, säger Vucic.