Den israeliska militären hade inför attacken uppmanat till utrymning av hamnen.
Enligt Israel används hamnen av Huthirebellerna för ”att överföra vapen från den iranska regimen, i syfte att genomföra attacker mot staten Israel och dess allierade”.
En talesperson för huthierna uppger i sociala medier att rebellernas luftvärn ”bemöter de israeliska flygplanen”.
Huthi-styret, som har kontroll över stora delar av Jemen, har anslutit sig på palestinska Hamas sida i Gazakriget och skickar bland annat robotar och drönare mot Israel.
Som svar har Israel löpande attackerat infrastruktur som hamnar, kraftverk och den internationella flygplatsen i huvudstaden Sanaa. Israel har den senaste tiden trappat upp och i augusti dödades huthiernas premiärminister Ahmed al-Rahawi och andra ledare.
al-Hudayda är det krigsdrabbade Jemens viktigaste hamn.