Ursäkten sågas av Netanyahus finansminister, den mer extreme Bezalel Smotrich, som kallar tilltaget för en ”skam” i ett inlägg på X.
Israels attack, som riktades mot Hamas förhandlingsdelegation i Doha, dödade fem personer och fördömdes på bred front.
Fram tills nu har Israel försvarat sitt agerande och till och med hotat Qatar och andra länder att man kommer att fortsätta på samma linje.
— Jag säger till Qatar och alla nationer som hyser terrorister, antingen utvisar ni dem eller ställer dem inför rätta. Om ni inte gör det, så kommer vi att göra det, sade Netanyahu i ett tal kort efter händelsen.