Enligt uppgift till nyhetssajten Euractiv är Malmström en av dem som intervjuats inför tillsättandet på torsdag.
Ytterligare minst en ex-kommissionär, nederländske förre viceordföranden Frans Timmermans, uppges finnas bland kandidaterna.
EU-finansierade College of Europe har sitt huvudsäte i Brygge i Belgien och vidareutbildar ungefär 500 personer om året. Många studenter går vidare till toppjobb inom exempelvis EU:s utrikestjänst.
Nuvarande rektorn Federica Mogherini, som var EU:s utrikeschef 2014–2019, avgick i förtid i vintras efter anklagelser om korruption och riggade upphandlingar till skolans fördel.
