Massie förlorade under natten till onsdagen partiets primärval i hemstaten och har därmed ingen chans att bli omvald vid mellanårsvalet i november.
Republikanernas kandidat blir i stället den tidigare elitsoldaten Ed Gallrein, som hade Trumps stöd.
Gallreins seger, i vad medier beskriver som den dyraste primärvalsrörelsen hittills, ses som en stor triumf för presidenten. Trump har flera gånger beskrivit Massie, som suttit i representanthuset sedan 2012, som ”en idiot”.
I sitt förlusttal antydde libertarianen Massie att han kan vara intresserad av presidentvalet 2028.
— Vi pratar om det senare, sade han enligt AP.