Utöver de sex döda har ”ett visst antal skadats” efter flygattacken riktad mot en polisstation i det Hamaskontrollerade området.
Shifa-sjukhuset i Gaza stad bekräftar att man tagit emot sex kroppar, däribland ett barn fött 2011.
En AFP-korrespondent på platsen såg minst tre kroppar insvepta i vita tygstycken.
En israelisk militärkälla säger till AFP att armén riktat in sig på ”Hamasterrorister” i området.
I Gaza råder det en vapenvila sedan oktober förra året, men Israel förbehåller sig rätten att anfalla mål som man anser utgöra ett hot. Trots vapenvilan angriper Israel Gazaremsan på regelbunden basis.
