Beslutet om att överklaga fattades under ett krismöte på onsdagskvällen.
— Vi är eniga om att vi vill pröva frågan en gång till, säger klubbens vice ordförande Pär Eriksson till radion.
Eskilstuna, som slutade åtta i damallsvenskan i år, är den enda av de svenska elitklubbarna att nekas elitlicens för nästa år. Det beror på att klubben uppvisade negativt eget kapital den 31 augusti i år.
En nekad elitlicens innebär att klubben tvångsnedflyttas till elitettan.