Anger, som för två veckor sedan tog karriärens andra pallplats när han slutade trea i sprinten i Canmore, har brottats med ansträngningsastma under en tid. Det har lett till en infektion.
"Edvin är pigg och mår bättre men har tillsammans med tränare och medicinska teamet beslutat att avstå från tävlingarna i Lahtis. Han fokuserar istället mot Drammen", säger landslagsläkare Rickard Noberius i ett uttalande från Svenska skidförbundet.
Anger ersätts av Anton Persson som därmed gör säsongsdebut i världscupen. Persson opererade knäet förra vintern.
Fyra tävlingshelger återstår i världscupen: Lahtis, Holmenkollen, Drammen och avslutningen i Falun.
"Lahtis är klassisk skidmark med många historiska mästerskap som avgjorts ute i skogarna runt arenan", säger landslagschefen Anders Byström.
Linn Svahn har goda chanser att vinna sprintcupen. Svahn leder med 187 poäng före norskan Kristine Stavås Skistad. Jonna Sundling är trea, 55 poäng efter Skistad.
Tävlingshelgen i Lahtis inleds med sprintstafett på fredag.