Kirk har varit avstängd av klubben sedan den 8 mars, i väntan på utredning kring anklagelserna.
Leicester går dock inte in i detalj kring varför man gör sig av med tränaren.
"Efter en noggrann disciplinär utredning och med respekt för klubbens krav på att värna om integriteten, har Willie ansetts ha brutit mot lagets uppförandekod på ett sådant sätt att hans position är ohållbar", skriver Leicester i ett pressmeddelande.
I väntan på en ny permanent lösning får assisterande tränaren Jennifer Foster huvudansvaret.
