Real Madrid-försvararen hamnade i blåsväder efter lördagens spanska cupfinal mot Barcelona, då han från bänken kastade ett föremål mot domaren, och fick rött kort.
Den 32-årige tysken byttes ut under förlängningen av cupfinalen, som Barcelona vann, och tilltaget gjorde att han riskerade en lång avstängning.
Under tisdagskvällen kom domen: Rüdiger stängs av i sex matcher.
Tidigare under dagen kom dock beskedet att han opererat ett knä och missar resten av säsongen.
Stor kritik har riktats mot Rüdiger efter hans utbrott. Inte minst från hans hemland där bland andra storspelarna Rudi Völler, som också är Tysklands landslagschef, och Lothar Matthäus har uttryckt sig.
— Han blev galen, han tappade kontrollen över sig själv, sade Matthäus enligt spanska AS.
Huvudpersonen själv har bett om ursäkt för sitt tilltag.