Marco Silva har lett Londonklubben under fem år och ledde Fulham 2025 till lagets poängrekord i Premier League.
”Fulham kommer alltid att finnas i mitt hjärta, och förr eller senare kommer jag att vara tillbaka på Craven Cottage", säger portugisen i ett uttalande.
Enligt brittiska uppgifter väntas Silva ersätta landsmannen José Mourinho på tränarbänken i den portugisiska toppklubben Benfica.
Mourinho uppges sin tur återvända till Real Madrid och det förväntas bli officiellt efter Reals ordförandeval den 7 juni, skriver BBC.
