Utredningen ska visa om X låtit oriktiga uppgifter spridas på plattformen. Kommissionen säger sig ha sänt en formell begäran till X om att få information i ämnet, i enlighet med EU-förordningen Digital services act (DSA) från 2020.
Utredningen inleds två dagar efter att Thierry Breton, EU-kommissionär för den inre marknaden, varnade plattformen och dess ägare Elon Musk i ett brev.
"Vi har indikationer på att din plattform används för att sprida illegalt innehåll och desinformation i EU", skrev Breton, enligt nyhetsbyrån AFP.