Obligationsinnehavaren har nu inlett formella rättsliga åtgärder.
SBB, som även tidigare tillbakavisat kravet, kallar det i ett pressmeddelande för "grundlöst".
Det var i november förra året som fastighetsbolaget fick ett krav från obligationsägaren som hävdade att SBB brutit mot villkoren i obligationsprogrammen.
Enligt fastighetsbolaget kan det ta omkring 18 månader innan det kommer en dom i ärendet.
