I torsdags sköts en biträdande polischef ihjäl i det myndigheterna kallar upplopp. Ytterligare två poliser ska ha skadats.
"44 personer som deltog i upploppen i ett antal regioner i kungariket har gripits och de kommer att ställas inför rätta", säger direktoratet för allmän säkerhet i ett uttalande.
I fredags varnade kung Abdullah II av Jordanien att "alla som höjer ett vapen mot staten kommer att behandlas hårt".
Taxi- och lastbilschaufförer i södra Jordanien började strejka för mer än en vecka sedan och fick senare förstärkning av busschaufförer och köpmän. Under veckan har vägar blockerats med brinnande däck och säkerhetsstyrkorna har i vissa områden konfronterats.
Bränslepriserna har nästan fördubblats i Jordanien jämfört med ett år tidigare – i synnerhet diesel som används av lastbilar och bussar.
