Herzog, vars ämbete främst har en ceremoniell och representativ roll, varnar för att en "tunna med sprängmedel" är på väg att explodera i ett redan splittrat land.
— Jag känner, vi alla känner, att vi befinner oss i ögonblicket före en kollision, rent av en våldsam kollision, säger presidenten i ett tv-sänt tal på söndagen.
Uppmaningen till premiärministern kommer kvällen innan delar av den omstridda lagstiftningen väntas tas upp i parlamentet.
Netanyahus nya ytterhögerregering vill förändra rättsväsendet för att bland annat ge politikerna i Knesset betydande makt över Israels högsta domstol.
Reformerna har mötts av starka folkliga protester, med stora demonstrationer runt om i landet sex lördagar i rad.
Kritikerna befarar att planerna riskerar att skada landets maktbalans och demokrati i grunden. Vissa ser det även som ett sätt för den korruptionsmisstänkte Netanyahu att själv undgå rättvisan.
En ny demonstration är planerad utanför parlamentet på måndag.
