En person skadades också allvarligt när en lyftkran välte i stormen. Zagrebs borgmästare Tomislav Tomasevic sade att staden aldrig tidigare upplevt en sådan storm "både när det gäller kraft och skada".
Även i grannlandet Slovenien dödades en person av ett fallande träd.
Klicka här för att följa oss på GoogleStormen på Balkan kommer samtidigt som södra Europa har drabbats av extremvärme med skogsbränder och hälsovarningar i flera länder.
