President Daniel Noboa säger att strömkrisen och ordern till arbetarna bland annat är ett resultat av "exempellös korruption och försumlighet" och att han har beordrat en utredning om korruptionsanklagelserna.
En av landets största vattenkraftsdammar, Mazar, är i det närmaste helt torrlagd och en annan stor damm är bara fylld till fyra procent.
Första offret för strömbristen blev energiminister Andrea Arrobo, som på tisdagen fick sparken.
Krisen förvärras dessutom av att Colombia, som normalt exporterar el till Ecuador, har liknande problem och i det närmaste ställt in all export.