Det indikerar att de sannolikt dödats av sina kidnappare, rapporterar israeliska medier med hänvisning till rapportens slutsatser.
Kropparna hittades bakom en lönnvägg i en tunnel under Khan Yunis i början av veckan. Ytterligare fyra kroppar hittades nära gisslans kvarlevor, enligt Israels militär troligen extremister.
Hostages and Missing Families Forum, en organisation som samlar anhöriga till gisslan i Gaza, svarar på obduktionsrapporten med att mana till en omedelbar överenskommelse mellan Israel och terrorstämplade Hamas.
"Återförandet av de sex kropparna är ingen prestation; det är ett bevis på det kompletta misslyckandet med att nå ett avtal i tid, då sex gisslan som skulle ha återvänt i livet har återvänt i kistor", säger de i ett uttalande.
