På söndagen förstördes en sovsal för drygt 150 elever i en pojkskola i Meru i östra delen av landet.
Branden startade när eleverna befann sig i en matsal. Inga dödsfall har rapporterats, däremot har "flera" personer skadats.
Natten till i fredags dog minst 21 personer i en brand på internatskolan Hillside Endarasha Primary i Nyeri, norr om huvudstaden Nairobi. I sovsalen där det brann fanns drygt 150 pojkar mellan 9 och 13 år.
Flera skadades i branden och fortfarande saknas en del barn.
På lördagen inträffade även en brand i en flickskola, cirka 14 mil nordost om Nyeri. Inga dödsfall har rapporterats.
President William Ruto har lovat att ansvariga för skolbränder ska ställas inför rätta.