En journalist från nyhetsbyrån såg tre soldater knuffa kropparna som föll utom synhåll.
Israeliska militären (IDF) uppger att händelsen utreds.
"Det här är en allvarlig incident som inte överensstämmer med IDF:s värderingar och förväntningarna på IDF-soldater", uppger militären i ett uttalande.
Enligt internationell lag ska soldater se till att döda kroppar behandlas anständigt, även stridande.
Enligt IDF dödades fyra militanter i räderna.
Över 700 palestinier har dödats av israelisk eld på Västbanken sedan kriget bröt ut efter Hamas terrorattack den 7 oktober, enligt palestinska myndigheter.
