Domaren går därmed Harvard till viljes och beslutar att stoppet ska gälla fram till att ärendet är avgjort i rätten, skriver AP. Beslutet är en förlängning av ett tidigare.
Trumpregeringen hade inför domarens besked på torsdagen backat och meddelat Harvard att lärosätet får 30 dagar på sig att rätta sig i ledet, vilket framgår av ett brev från immigrationsmyndigheten ICE, rapporterar ABC News.
Regeringen anklagar Harvard, beläget i Cambridge i delstaten Massachusetts, för bland annat antisemitism och har krävt att universitetet ska upphöra med satsningar på mångfald, rättvisa och inkludering.
Flera hot och åtgärder riktas mot Harvard. Regeringen har bland annat fryst forskningsanslag på mer än 2,6 miljarder dollar och sagt sig vilja se över alla statliga kontrakt.
De senaste turerna sker samtidigt som tusentals studenter och deras familjer på torsdagen samlas för examensfirande på Harvard.
Universitet har cirka 7 000 utländska studenter, enligt ABC.