Pakistans mål är att 800 000 afghaner som befinner sig i Pakistan och som har fått sina uppehållstillstånd återkallade ska lämna landet, bland dem vissa som är födda i Pakistan eller har bott där i tiotals år.
I april lämnade 135 000 afghaner Pakistan, i maj 67 000 och under de första dagarna i juni 3 000 enligt inrikesdepartementets uppgifter.
Miljoner afghaner har under de senaste årtiondena flytt till Pakistan från våldsamma konflikter i sitt hemland.