Massgraven upptäcktes under arbetet med ett bygge, berättar delstatens åklagare Salvador González vid en presskonferens.
Den hittades först i februari. Därefter har utredarna arbetat med markradar och hundar i sökandet efter kroppar.
I delstaten finns narkotikakartellen Jalisco nueva generación, som klassificerats av USA som en terroristorganisation.
Mexiko är svårt plågat av gängvåld och fler än 480 000 personer har dödats sedan 2006.
