Uttalandet från presidenten kommer efter en våg av protester mot korruption, polisbrutalitet och Kenyas svaga ekonomi.
"De vill starta kaos, organisera protester, bränna folks egendom och störta regeringen före 2027", sade Ruto till väljare i huvudstaden Nairobi och syftade på nästa planerade val i landet.
Presidenten, som valdes 2022, sade också att alla attacker mot polisen ska ses som en ”krigsförklaring” och hävdade att våldsamma demonstranter ”borde skjutas i benet, föras till sjukhus, och föras till domstol”.
Oppositionsledare anklagar regeringen för att bedriva "fientligt", statssponsrat våld mot sina medborgare.
Senast i måndags dog 31 personer i våldsamma sammandrabbningar mellan polis och demonstranter. Ytterligare över 500 personer uppges ha gripits och 107 skadats.
Kenyas nationella kommission för mänskliga rättigheter (KNCHR) anklagade då polisen för att samarbeta med kriminella gäng som ska ha deltagit i våldet, vilket polisen dementerar.
Sedan protesterna inleddes i fjol har över 100 personer dödats.