De två männen greps i april efter att tips från allmänheten nått regionens shariapolis. Efter en fyra månader lång häktning verkställdes de 76 piskrappen inför en folksamling i en park i regionens huvudstad.
Banda Aceh iakttar en drakonisk tolkning av muslimsk sharialag där tortyr och kroppslig bestraffning är legio för samkönat sex. Även sex utanför äktenskapet liksom hasardspel och hantering av alkohol straffas med piskning.
Efter att regionen fått en särskild autonom status inom Indonesien år 2001 infördes snabbt den ultrareligiösa tolkningen av muslimsk sharialag.
Människorättsorganisationer har fördömt händelsen.