Enligt Hegseth dödades tre drogsmugglande ”terrorister” från en colombiansk vänsterrebellgrupp i attacken, som ska ha skett den 17 oktober på internationellt vatten.
Exakt var den skedde framgår inte.
Den är den senaste i raden av attacker mot båtar som enligt den amerikanska administrationen smugglar droger till USA.
Totalt har minst ett 30-tal personer dödats i angreppen, som mestadels skett utanför Venezuelas kust. På onsdagen gav USA:s president Donald Trump underrättelsetjänsten CIA grönt ljus till hemliga operationer inne i Venezuela.
Trump har även gjort sig ovän med Colombias president Gustavo Petro, som anklagar USA för att ha kränkt landets suveränitet vid en attack mot en båt i september där en oskyldig fiskare uppges ha dödats.
Trump har svarat med att kalla Petro för ”knarkhandlare”.