Sané väntades starta som vänsterytter mot Japan, men nu får förbundskapten Hansi Flick hitta andra lösningar.
I den tyska VM-truppen saknas redan starka offensiva namn som Timo Werner och Marco Reus, som båda missar mästerskapet på grund av fotskador.
Även Spanien och Costa Rica ingår i Tysklands grupp.