Anledningen är att flaggor använts av supportrar för att gömma sig, för att sedan bränna av pyrotekniska pjäser.
"Svensk ishockey kommer aldrig att tillåta att brott begås i våra arenor i samband med ishockeyevenemang," skriver förbundets tävlingsnämnd i ett uttalande.
Djurgården straffas med flaggförbud i tio bortamatcher, Troja-Ljungby i fem bortamatcher och Luleå i fem hemmamatcher.
Sedan tidigare har också Västerås IK straffats med flaggförbud.
