Hercules avgjorde i den 70:e minuten när saudiska al-Hilal besegrades med 2–1.
Matheus Martinelli gav Riolaget ledningen i 40:e minuten innan brasilianske forwarden Marcos Leonardo kvitterade för al-Hilal.
Det kan bli ett helbrasilianskt möte i semifinalen då Fluminense ställs mot vinnaren i kvartsfinalen mellan engelska Chelsea och Palmeiras.
