På tilläggstid i första halvlek kolliderade Musiala med PSG-målvakten Gianluigi Donnarumma.
TV-bilderna visade att flera spelare blev förtvivlade över skadan där 22-årige Musiala fastnade med vänsterfoten under Donnarumma.
Av bilderna att döma har han råkat ut för en svår fot- eller benskada och han fick bäras ut på bår.
Jamal Musiala hade gjort tre mål i turneringen och totalt 20 under säsongen.
Champions League-mästaren PSG vann matchen med 2–0 efter sena mål av Desire Doue och Ousmane Dembele och är klart för semifinal.