Den 38-årige argentinaren såg ut att få behandling för övre delen av sitt högra ben innan han klev ut i omklädningsrummet för egen maskin.
Skadan fick Messi när han dribblade på offensiv planhalva och halkade och sprang in i motståndarnas back Alexis Pena. Messi föll och slog i gräset av frustration.
Stjärnan försökte fortsätta efter incidenten, men satte sig ner bara en kort stund senare och signalerade att han inte kunde fortsätta.
— Han kände obehag och vi kommer inte att få reda på mer om hur allvarlig skadan är förrän i morgon (söndag), sade Miamis tränare Javier Mascherano efter matchen.
Messi får trösta sig med att Miami åtminstone vann mötet med 5–4 efter straffar.
