"Amerikanen misstänks för att samla underrättelseinformation i den biologiska sfären, riktad mot den ryska federationens säkerhet", står det i ett uttalande.
Banden mellan Ryssland och USA har försämrats sedan Ryssland inledde sitt invasionskrig i Ukraina i fjol. Flera USA-medborgare sitter frihetsberövade i Ryssland och länderna anklagar varandra för att gripa personer av politiska skäl.
Flera fångutbyten har genomförts mellan länderna. I december släpptes den amerikanska basketstjärnan Brittney Griner från ryskt fängelse samtidigt som USA släppte den ryske vapenhandlaren Viktor But.
