Beslagen beräknas motsvara ett värde på över 280 miljoner dollar, motsvarande närmare tre miljarder kronor.
Ecuador har de senaste åren fått en stor roll i den internationella droghandeln som transitland för framförallt kokain. Drogkartellerna har utnyttjat landets strategiska läge mellan grannländerna Peru och Colombia, där majoriteten av kokainet i världen framställs.
Utvecklingen har lett till att det fram till nyligen relativt säkra landet fått stora problem med kartellvåld och kriminalitet.