Innan själva ceremonin inleddes gick Harris fram till Trump, skakade hans hand och de båda talades vid en kort stund.
Under minnesstunden lästes namnen på de nära 3 000 offren upp av anhöriga.
De närvarande kommer enligt uppgifter inte att ge några intervjuer, men Harris har gjort följande uttalande i samband med ceremonin:
"Vi känner solidaritet med deras nära och kära. Vi hedrar också det utomordentliga hjältemod som uppvisades den ödesdigra dagen av vanliga amerikaner."
Det är i dag 23 år sedan al-Qaidas terrordåd mot USA, då World Trade Center i New York raserades och försvarshögkvarteret Pentagon i Washington attackerades.