Tre män dödades, varav en man som arbetade som säkerhetsvakt i moskén, i måndagens dåd.
De misstänkta, en 17-årig pojke och en 18-årig man, hittades döda i samband med polisinsatsen vid en bil i närheten av moskén och tros ha tagit sina egna liv.
Förutom en mängd skjutvapen har polisen säkrat ett manifest vid husrannsakningarna, skriver nyhetsbyrån AP. Myndigheterna vill inte specificera innehållet men det handlar om texter med hat riktat mot en rad religioner och grupper.
”Tidigt skede av utredningen”
Händelsen utreds som hatbrott, men det är inte fastställt om moskén var det huvudsakliga målet.
— Vi är i ett för tidigt skede av utredningen för att kunna säga att San Diegos islamiska center var det specifika målet. Vi värderar och analyserar alla bevis, sade Mark Remily vid den federala polisen FBI på en pressträff på tisdagen enligt CNN.
— Vad jag kan säga är att de definitivt hade ett brett hat mot många människor.
Redan på morgonen, timmar innan skjutningen, hade en av tonåringarnas mamma oroligt hört av sig till polisen. Sonen beskrevs som självmordsbenägen och hade försvunnit från hemmet med vapen.
En sökinsats inleddes, men polisen lyckades inte hitta honom i tid.
Barn eskorterades ut
Moskén har en egen skola för elever från fem år och uppåt. Många barn var också på plats när skottlossningen bröt ut vid lunchtid på måndagen, men alla klarade sig.
Både polisen och företrädare för moskén beskriver det som att den ihjälskjutne säkerhetsvaktens insats hindrade skyttarna från att gå vidare in i byggnaderna.
— Han räddade utan tvekan liv, sade polischefen Scott Wahl på en tidigare pressträff.