Slovenen leder sammanlagt med 3 minuter och 31 sekunder före dansken efter en imponerande bergsetapp.
Inför årets upplaga av den klassiska cykeltävlingen var förväntningarna stora inför duellen mellan de senaste årens dominanter Tadej Pogacar och Jonas Vingegaard.
Men på torsdagen, när touren kom in i Pyrenéerna och det var dags för den första bergsetappen, visade Pogacar prov på en cykling som kan ha avgjort hela Tour de France.
Pogacar ryckte när det det återstod åtta kilometer. I mål var han sedan två minuter och tio sekunder före Vingegaard.
