Enligt tillsynsmyndigheten har banken bland annat visat stora brister i bland annat att rapportera misstänkta transaktioner till Polisen.
”Det har inneburit en uppenbar risk för att kriminella har kunnat utnyttja Intergiro för att tvätta brottsvinster. Det är mycket allvarligt och därför återkallar vi Intergiros tillstånd”, säger Malin Alpen, områdeschef för betalningar på FI, i ett pressmeddelande.
Bankens verksamhet ska vara avvecklad senast den 19 september i år.
Intergiro blev omtalat efter att SVT:s Uppdrag granskning i våras visat att flera personer dömda för bland annat ekobrott fanns i bankens ledning och bland delägarna.
Banken, som enbart finns på nätet utan fysiska kontor, har haft tillstånd att ge ut elektroniska pengar och har också kunnat erbjuda vissa betaltjänster, som till exempel genomförande av betalningstransaktioner.