Mannen åtalas för två fall av grovt folkrättsbrott, även kallat krigsbrott, i syriska Yarmuk söder om huvudstaden Damaskus.
Händelserna ägde rum medan inbördeskriget rasade, 2012 och 2013.
Ett av fallen rör sig delaktighet i angrepp på en fredlig demonstration den 13 juli 2012, där flera civila sköts till döds och flera skadades, enligt ett pressmeddelande från Åklagarmyndigheten.
Lett till svårt lidande
Han åtalas också för bemanning av en vägspärr och delaktighet i gripande av civila vid vägspärren, i samband med att Yarmuk belägrades av den syriska regimen och regimtrogna väpnade grupper, skriver myndigheten.
Ett stort antal civila greps vid vägspärren och överlämnades till den syriska säkerhetstjänsten under den fruktade diktatorn Bashar al-Assads styre, vilket lett till svårt lidande och i flera fall att människor har dött, enligt åtalet.
Mannen ska ha agerat som del av en regimtrogen väpnad milis.
”Brottet bör ses som grovt eftersom flera människor dödats, torterats och utsatts för svårt lidande och omänsklig behandling”, säger senior åklagare Ulrika Bentelius Egelrud.
”Mestadels hörsägen”
Mannen nekar till anklagelserna, säger Sargon de Basso, en av hans advokater.
— Åtalet är i ansvarsdelen i princip uteslutande grundat på muntlig bevisning, mestadels hörsägen, säger de Basso.
Utredningen har skett i samarbete med Tyskland och flera andra europeiska länder. Ett stort antal personer har förhörts, både i Sverige och utomlands, enligt Åklagarmyndigheten.