Mannen i 40-årsåldern utreds för kopplingar till PCPA, skriver Israels utrikesdepartement på X. Han är en av två deltagare från konvojen som nu förs vidare till Israel för förhör.
Israel klassar PCPA som en terrororganisation. Enligt landets försvarsdepartement fungerar gruppen som Hamas representativa organ utanför Gazaremsan.
Organisationen bakom konvojen, Global Sumud Flotilla, uppger att mannen har svenskt medborgarskap men är hemmahörande i ett annat EU-land.
I samband med insatsen på torsdagen stoppade Israels militär ett 20-tal av båtarna i Gazakonvojen nära Kreta i Medelhavet. Flera av aktivisterna – däribland flera svenskar – fördes i land i Grekland.
Svenska UD bekräftar för SvD att mannen hålls i förvar av Israel.
