25 män har förhörts och sju av dem gripits. Nätverket leds av en rysk-moldavisk person.
En agent lyckades infiltrera nätverket – vilket tillförde tio timmars inspelat video- och ljudmaterial, enligt polischefen Viorel Cernauteanu.
Missa inget viktigt, följ oss på Google— Folk kom från Ryssland med en mycket specifik träningsroll, säger Cernauteanu.
Myndigheterna agerade efter att de informerats om organisationen och deras avsikter.
Den pro-ryska oligarken Ilan Shors parti har under de senaste veckorna mobiliserat människor mot den västvänliga regeringen – mitt under de ökade spänningarna mellan Moskva och Chisinau.
Partiet har ordnat flera protester för vilka de misstänks ha betalat deltagarna. På söndagen inleddes en ny protest i huvudstaden.
USA anklagade i fredags Ryssland för att försöka destabilisera Moldavien – med målet att så småningom få igenom en Moskvavänlig regering.
USA meddelade samtidigt att de intensifierat underrättelseutbytet med Moldavien.
Ryssland möjliggör sedan många år ett utbrytarstyre i regionen Transnistrien i östra Moldavien och där finns ett par tusen ryska soldater.
